métodos para troca mais rápida de calor da câmara de reação e desenvolvimento de uma mistura de reação homogênea, em que as moléculas fluorogênicas estão presentes no mesmo vaso de reação em que ocorre a amplificação.

desenvolvimento de microarranjos, quase sempre designados comumente de “chips genéticos” e detecção de amplicons por diferentes tipos de sondas oligonucleotídicas marcadas por fluorescência.

Análise do produto amplificado por meio de eletroforese em gel de agarose e aplicação da técnica denominada de hibridização reversa para se determinar a sonda que se hibridizou aos amplicons.

sequenciamento por síntese ou pirosequenciamento e incorporação de didesoxinucleotídeos a um filamento de DNA em expansão.

uso de múltiplos conjuntos de iniciadores ou “primers”, cada um deles tendo geralmente como alvo um patógeno específico e a utilização de brometo de etídio como revelador ou corante.