Acredita-se que 90% da encoprese infantil crônica seja funcional. Contudo, em alguns casos, a incontinência fecal é causada por condições clínicas, incluindo inervação anormal da região anorretal, doença de Hirschsprung com segmento ultracurto, displasia neuronal intestinal ou dano à medula espinal.

Um plano de tratamento típico para uma criança com encoprese inclui administração oral diária de laxantes. Além disso, indica-se uma intervenção cognitivo-comportamental para iniciar tentativas regulares de realizar movimentos intestinais no banheiro e reduzir a ansiedade quanto a movimentos intestinais.

Para que o diagnóstico de enurese possa ser feito, a criança deve exibir idade cronológica ou de desenvolvimento de pelo menos sete anos.

Embora a maioria das crianças com enurese não apresente transtornos psiquiátricos comórbidos, crianças com esse problema têm maior risco de desenvolver outro transtorno psiquiátrico, como TDAH e encoprese.