A implantação da farmácia clínica de um hospital ocorre a partir da implementação de um centro de informações de medicamentos.

Para o bom andamento das atividades do farmacêutico clínico, é imprescindível a existência de sistemas informatizados.

O farmacêutico clínico compõe várias comissões hospitalares como a de farmácia e terapêutica e de controle de infecção hospitalar, mas não é atuante na comissão de nutrição parenteral.

Alguns aspectos devem ser observados pelo farmacêutico clínico na prescrição, uma delas é a interação medicamento X alimento, que consiste na interferência do medicamento nos resultados dos exames laboratoriais.

O farmacêutico clínico deve fornecer informações a outros profissionais da equipe, bem como promover aulas para a atualização de profissionais da área da saúde.