Em ovinos os sinais iniciais observados em animais infectados por vírus da febre aftosa são: febre, anorexia, calafrios e redução da produção de leite durante 2 ou 3 dias

A maior parte das populações de búfalos africanos (Syncerus caffer) mantidos em liberdade tem altos índices de infecção com vírus de febre aftosa e alguns animais podem manter a infecção por períodos de, ao menos, 5 anos

As lesões são menos pronunciadas em bovinos e suínos

A agalactia é característica em ovinos, caprinos e bovinos leiteiros

Em suínos, depois de 24 horas de sua aparição, produzse a ruptura das vesículas, deixando erosões nas superfícies afetadas. Também podem aparecer vesículas nas glândulas mamárias