Depois da criação dos particionamentos e a gravação na tabela de partição no início do HD (com informações como endereço de início e final de cada partição), são necessárias a formatação e a escolha do sistema de arquivos, que deverá ser igual para todas as partições da memória secundária.

Um HD que seja vendido como tendo capacidade de 500 GB possui, na verdade, 500 bilhões de bytes que correspondem a apenas 465.6 GB. Isso se dá pois os fabricantes seguem o padrão decimal para indicar a capacidade de seus produtos, e não o padrão binário.

Ao trocar de sistema operacional, você geralmente sobrescreve a MBR com um novo gerenciador de boot, mas a tabela de particionamento só é modificada ao criar ou deletar partições; e se ela for sobrescrita ou danificada, perde-se acesso a todas as partições do HD.

Em casos em que as partições são apagadas ou a tabela é corrompida, o trabalho de recuperação de dados é feito em duas partes, em que, na primeira, recuperam-se as partições originais e, na segunda, se necessário, recuperam-se os arquivos que estavam dentro delas.

Defeitos na placa lógica do HD podem ser resolvidos com a substituição dos componentes avariados ou com a substituição da placa lógica inteira por outra, retirada de um HD do mesmo modelo. Defeitos nos componentes internos do HD demandam os serviços de uma empresa especializada em recuperação de dados, que tenha uma sala limpa e a aparelhagem necessária.