O processo de escolha é baseado em critérios epidemiológicos locais, que independem do valor do medicamento.

A seleção é estabelecida pela Comissão de Farmácia e Terapêutica, formada exclusivamente por farmacêuticos e representantes da indústria farmacêutica.

Cabe à assistência farmacêutica elaborar o formulário terapêutico, que deve conter todas as informações pertinentes à estrutura química, à estabilidade do medicamento e às formas de armazenamento.

A seleção deve levar em consideração o preço dos medicamentos selecionados.

Nessa fase do ciclo da assistência farmacêutica, é racionalizado o uso de medicamentos.