Na Síndrome de Sjögren, as manifestações mais comuns são queratoconjuntivite seca e xerostomia, sendo necessária a biópsia glandular e solicitação de provas reumáticas na investigação diagnóstica.

A herpangina é uma estomatite causada pelo Coxsackie vírus A, sendo mais frequente em adultos do que em crianças.

Na candidíase oral, a forma eritematosa ou atrófica é a apresentação mais clássica da doença.

As lesões orais da paracoccidioidomicose, denominadas de estomatites moriformes, são caracterizadas por múltiplas aftas.

O líquen plano da cavidade oral se apresenta como placas avermelhadas na região jugal.