A coleta da amostra liquefeita ou aquosa deve ser feita diretamente no frasco estéril e processada imediatamente após a coleta. Como a amostra é liquefeita, a mesma deve ser centrifugada para pesquisa de ovos de helmintos.

Amostras de fezes formadas ou endurecidas podem ser examinadas no mesmo dia ou no dia seguinte. Sempre preservar em temperatura ambiente, não sendo aconselhado colocar em geladeira.

A pesquisa de protozoários e suas formas reprodutivas não sofrem interferência do uso de medicamentos pelo paciente, até mesmo de contrastes radiográficos.

O método de sedimentação pode ser utilizado para qualquer tipo de amostra fecal desde que conservada e em quantidade adequada. Destina-se à pesquisa de helmintos e protozoários e é o método mais utilizado na prática diária.