No diagnóstico da rinossinusite aguda, quando rinossinusite fúngica é considerada, devem ser feitas biópsias das áreas afetadas.

Em casos mais graves deve sempre ser solicitado TC ou radiografia dos seios paranasais. A rinossinusite nosocomial deve ser confirmada por TC de seios da face, com o material aspirado sendo encaminhado para cultura e testes de suscetibilidade (idealmente antes do início da terapia antimicrobiana).