O aspecto mais crítico na técnica de aplicação de selantes é o isolamento do campo operatório.

Embora a utilização de isolamento absoluto seja o melhor método de assegurar um campo livre de contaminação, não há evidências definitivas de sua superioridade em relação ao isolamento relativo.

A limpeza da superfície a ser selada, preferentemente por meio de profilaxia, é uma etapa importante para remoção de material orgânico das fossas e fissuras, permitindo ação direta do condicionamento ácido sobre o esmalte.

Sugere-se um tempo de condicionamento ácido entre 30 e 45 segundos em dentes decíduos e permanentes, seguido de cuidadosa lavagem e secagem da superfície após a aplicação do selante.