o Aparelho de EMTr é dotado de um circuito de carregamento, onde a energia fica armazenada em um banco de capacitores de alta voltagem, na forma de carga eletrodinâmica.

em geral, as frequências menores do que 1Hz são excitatórias, e as frequências maiores do que 1 Hz são inibitórias.

o campo magnético induzido é proporcional à distância do tecido cerebral até a bobina, e a profundidade máxima de estimulação estimada na região de maior intensidade de estímulo da bobina é de 5 cm abaixo do escalpe.

na EMTr, a amplitude do campo elétrico induzido não decai em função da distância da bobina.