Neurocriptococose é uma meningoencefalite causada pelo fungo Criptococcus neoformans, e ocorre habitualmente quando a contagem de linfócitos CD4 está acima de 100/mm³.

Lesões circundadas por "anel", ou reforço pelo contraste, especialmente nos gânglios da base, são observados na tomografia computadorizada na neurotoxoplasmose.

A presença de retinite, esofagite, colite, hepatite e doença biliar são indicativos de estrongiloidíase disseminada.

A infecção disseminada pelo complexo Mycobacterium avium-intracellulare representa mais comumente uma reativação de infecção remota latente, e não infecção recentemente adquirida.

A leucoencefalopatia multifocal progressiva é causada por fungos, geralmente quando a contagem de linfócitos CD4 é inferior a 100/mm³, e não há melhora, mesmo com o tratamento eficaz da infecção pelo HIV.