Claramente, no desenho e execução de protocolos, evitar efeitos indesejados ao bem-estar de animais envolve muito mais que a seleção de agentes anestésicos ou analgésicos adequados ou o fornecimento apropriado de água, comida, temperatura, umidade ou luz. A boa prática científica tem interesse na preservação do bem-estar dos animais utilizados e na identificação, no controle e, sempre que possível, na eliminação dos fatores que possam causar respostas fisiológicas ou comportamentais associadas a estresse ou dor. Quando o estresse e/ou a dor fazem parte de um procedimento de pesquisa, estratégias para minimizar ou controlar esses efeitos são componentes essenciais do desenho experimental. Se o bem-estar de um animal for comprometido, as consequências a seguir podem ocorrer, com EXCEÇÃO de: