As regiões situadas entre as sequências hipervariáveis, que fazem parte do domínio V, exigem menos variabilidade e são conhecidas como regiões estruturais.

As três alças hipervariáveis determinam a especificidade ao antígeno pela formação de uma superfície complementar designada de regiões determinantes de complementaridade.

Três regiões de especial variabilidade podem ser identificadas nos domínios V das cadeias pesadas (V_H) e leves (V_L), conhecidas como regiões de hipervariabilidade; são chamadas: HV1, HV2 e HV3.

As regiões variáveis de um anticorpo são diferentes para cada molécula de anticorpo. A variabilidade da sequência é uniformemente distribuída nas regiões variáveis e concentrada em alguns locais da região variável.

Uma consequência da contribuição das regiões determinantes de complementaridade dos domínios V_H e V_L para o sítio de ligação ao antígeno é o fato da combinação das cadeias pesada e leve determinar a especificidade antigênica final.