O tratamento deve ser iniciado imediatamente em casos suspeitos, sem a necessidade de confirmação laboratorial.

A quimioprofilaxia é indicada como uma medida ampla de saúde pública para prevenir a leptospirose em populações expostas durante enchentes.

A definição de caso suspeito inclui indivíduos com febre e mialgia que tiveram contato com água ou lama de inundação.

Em situações de enchentes, além da leptospirose, outras doenças infecciosas, como hepatite A infecções respiratórias, devem ser consideradas no diagnóstico diferencial.

A antibioticoterapia é mais eficaz quando iniciada na primeira semana do início dos sintomas, mas pode ser utilizada em qualquer fase da doença.