Os resíduos com a possível presença de agentes biológicos que, por suas características de maior virulência ou concentração, podem apresentar risco de infecção (Grupo A1), devem ser submetidos preliminarmente a processos de tratamento em equipamento que promova redução da carga microbiana.

Os resíduos hospitalares de qualquer natureza devem ser queimados, desde que as cinzas sejam reaproveitadas em áreas de reflorestamento.

Os resíduos comuns não fazem parte do PGRSS. Sendo assim, a sua disposição final não é monitorada pelos indicadores de gerenciamento.

Os locais de destino dos resíduos de serviço de saúde devem possuir alvará emitido pela Vigilância Sanitária e estão isentos de licenças ambientais de operação.

Os resíduos do Grupo E, materiais perfurocortantes, podem ser descartados em valas sem cobertura e impermeabilização.