A auditoria interna deve efetuar o seu planejamento do trabalho de forma independente de diretrizes emanadas da entidade auditada, seguindo orientações da auditoria externa.

Cabe ao Sistema de Controle Interno do Poder Executivo Federal, por intermédio da técnica de auditoria, realizar auditorias somente nos sistemas contábil e financeiro, excluindo o de pessoal.

Os órgãos e as unidades do Sistema de Controle Interno do Poder Executivo Federal, nos seus trabalhos de fiscalização e auditoria, verificarão somente nos órgãos federais se o objeto pactuado, nos instrumentos em que a União assume compromissos, com previsão de transferência de recursos financeiros de seus orçamentos, foi executado.