O alagamento do solo promove a solubilização de ferro, podendo o acúmulo de Fe³⁺ na solução do solo atingir níveis tóxicos ao arroz.

A toxidez por ácidos orgânicos se manifesta nas fases iniciais do desenvolvimento da planta, caracterizando-se por menor germinação, menor crescimento radicular e menor peso e estatura de planta.

A sensibilidade do arroz à salinidade varia conforme o estágio de desenvolvimento da planta, sendo críticas as fases de germinação e enchimento de grãos.

A toxidez por ferro pode ocorrer por absorção excessiva (alaranjamento), ou por deficiência nutricional múltipla (bronzeamento), quando afeta a absorção de outros elementos (N, Ca, Mg, K, P, Si, Na e Mn).