O sequenciamento de DNA de amostras biológicas obtidas de fósseis e restos arqueológicos é impreciso devido à degradação e contaminação do DNA ao longo do tempo, sendo impraticável pelo fato de gerar resultados não satisfatórios.

Atualmente o estado da arte sobre o tema sequenciamento de genomas inteiros ainda é um processo de baixo rendimento e pouco preciso, o que tem prejudicado estudos populacionais para explorar a diversidade genética.

A semelhança do genoma humano não permite que o sequenciamento de DNA de amostras de populações ancestrais forneça informações sobre a história humana.

O princípio da técnica do sequenciamento Sanger não contribuiu para o desenvolvimento de técnicas de sequenciamento de próxima geração (NGS), visto que se utilizam de princípios bastante distintos.

A descoberta da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) trouxe enormes benefícios para o desenvolvimento das técnicas de sequenciamento de genomas.