A limpeza do consultório odontológico deve iniciar da área mais contaminada para a menos contaminada.

Todos os resíduos biológicos dos serviços de saúde são classificados como resíduos de grupo E e devem ser acondicionados em caixas específicas rígidas.

Em procedimentos odontológicos com presença de matéria orgânica, as peças de mão podem ficar contaminadas. Portanto, recomenda-se a desinfecção desses artigos entre o atendimento dos pacientes.

Em equipamentos odontológicos dotados de sistemas de desinfecção das tubulações, deve-se adicionar, no recipiente destinado à assepsia da tubulação, 25ml de hipoclorito de sódio a 1% e 475ml de água, devendo renovar essa solução semanalmente.

Em superfícies que há matéria orgânica, deve-se aplicar solução de hipoclorito de sódio a 1% e aguardar cinco minutos para, posteriormente, remover com auxílio de papel-toalha, que deve ser descartado. Após esse procedimento, deve-se realizar a limpeza com água e sabão.