No que se refere à raiz propriamente dita, seu crescimento e desenvolvimento é dinâmico e altamente dependente do ambiente do solo. As células do ápice radicular são produzidas continuamente e são transitórias, desprendendo-se da superfície do ápice radicular por descamação, em poucos dias. Essas células podem ser encontradas, ainda vivas, no solo que circunda as raízes e são decompostas por autólise ou por microrganismos. Além do desprendimento dessas células, o sistema radicular, durante seu processo de crescimento, libera uma quantidade considerável de compostos orgânicos na rizosfera. Esses compostos variam ao longo do sistema radicular, tanto no que se refere à concentração quanto à natureza química. Em média, de 30 a 60% do carbono fotoassimilado é alocado para as raízes e, deste carbono, cerca de 40 a 70% pode vir a ser liberado na rizosfera. Essa liberação de carbono é denominada rizodeposição. No que se trata da inibição da colonização, um efeito indireto é: