No processamento farmacêutico, a filtração pode ser realizada para separar um sólido de um líquido ou para separar 2 líquidos, mas não é um método aplicável para a separação sólido/gás.

As centrífugas de cesto perfurado podem ser adaptadas para a separação de líquidos imiscíveis ao controlar a velocidade de entrada do produto, de modo a garantir o tempo necessário de sedimentação, antes que o produto deixe o recipiente.

São consideradas formas de aumentar a velocidade de filtração: diminuir a diferença de pressão por meio da torta filtrante, aumentar a viscosidade do filtrado, aumentar a espessura da torta filtrante.

A filtração por superfície é utilizada quando o nível do contaminante é baixo ou pequenos volumes precisam ser filtrados, podendo ser adotados filtros de membrana, com poros menores que o material a ser filtrado, para essa finalidade.