O benefício adicional do uso de antibióticos sistémicos em locais de profundidade de bolsa moderada é amplo, justificando seu uso.

De acordo com o entendimento atual da doença periodontal, envolvendo o tripé disbiose da flora bucal, resposta imunoinflamatória e fatores sistémicos, comportamentais e genéticos, seu uso é inquestionável.

Exceções que podem indicar tratamentos com antibióticos adjuntos incluem sítios localizados com maior profundidade de bolsa á sondagem, com doença persistente ou recorrente e pacientes portadores de diabetes mellitus não controlados.

A profilaxia antibiótica deve ser indicada para pacientes comprometidos com doença cardíaca reumática, revascularização do miocárdio, prolapso da válvula mitral e infarto do miocárdio.

A associação de metronidazol e amoxicilina é ineficaz, precisamente porque altera o microbioma bucal de disbiose para eubiose.