As encefalites equinas são doenças infecto-contagiosas zoonóticas, de caráter agudo, causadas por vírus da família Togaviridae, gênero Alphavirus, com uma grande variedade de hospedeiros e reservatórios. Os agentes causais são RNA-vírus, de cadeia simples, não segmentados, de sentido positivo, esféricos e possuem cinco proteínas estruturais, sendo a mais conservada, a: