Os laboratórios de microbiologia são classificados em níveis de biossegurança conforme o risco dos agentes biológicos manipulados, as medidas de contenção adotadas e o potencial de transmissão. Um laboratório que realiza análises microbiológicas de amostras de água para a detecção de coliformes totais, Escherichia coli, bactérias entéricas patogênicas de baixa virulência, vírus entéricos sem transmissão aérea significativa (como adenovírus e rotavírus) e protozoários patogênicos não altamente virulentos (como Giardia e Cryptosporidium) deve ser classificado em qual nível de biossegurança, de acordo com a RDC nº 786/2023 da Anvisa?