Os nematoides endoparasitas possuem uma cutícula espessa e rígida, enquanto os ectoparasitas possuem uma cutícula fina e flexível.

Os nematoides endoparasitas possuem uma extremidade posterior mais afilada e pontiaguda, enquanto os ectoparasitas possuem uma extremidade posterior mais arredondada.

Os nematoides endoparasitas possuem um corpo mais cilíndrico e alongado, enquanto os ectoparasitas possuem um corpo mais achatado e largo.

Os nematoides endoparasitas possuem um sistema digestório mais complexo, com uma faringe muscular bem desenvolvida, enquanto os ectoparasitas possuem uma faringe reduzida ou ausente.

Os nematoides endoparasitas possuem uma cabeça bem definida e diferenciada, com papilas e sensilas especializadas, enquanto os ectoparasitas possuem uma cabeça simples e pouco diferenciada.