A hemoglobinúria paroxística noturna é um distúrbio clonal devido a uma mutação adquirida no gene PIGA das células-tronco hematopoiéticas. Mutações no PIGA acabam causando diminuição das proteínas ancoradas no GPI, como a CD59, e proteína reguladora do complemento, na superfície dos eritrócitos.

Após o desenvolvimento dessa patologia, o indivíduo poderá apresentar