Desconsideram que o plano de ensino da escola será colocado em prática concretamente; muitos julgam que ficará só no discurso.

Algumas instituições exigem um planejamento participativo durante a organização do documento na escola e não como um instrumento de transformação social.

Compreensão da dimensão social e histórica do trabalho a ser realizado através do planejamento, partindo da realidade concreta e voltado para atingir as finalidades da educação básica definidas no projeto coletivo da escola.

Ausência de clareza teórico-conceitual e metodológica de certos conceitos utilizados com frequência nos marcos referenciais tais como: democracia, participação, justiça, liberdade, solidariedade, igualdade, consciência crítica.