a posição dos picos de determinado mineral pode mudar, porque grandes desvios podem ocorrer, principalmente pela variação na sua composição.

a intensidade e a largura dos picos não dependem da cristalinidade das fases.

as intensidades relativas dos picos são afetadas pela orientação preferencial na preparação das amostras, superposição de picos de diferentes fases e variação da composição dos minerais, e por outros fatores.

à medida que coexistam na amostra diversos minerais, a complexidade das estruturas aumenta e a intervenção do operador se torna mais irrelevante.

os minerais intempéricos apresentam boa cristalinidade e alto teor de ferro, o que torna sua identificação mais complicada quando analisados em equipamento de difração de raios X com tubos de cobre.