O índice de desenvolvimento de febre reumática após faringotonsilite estreptocócica não tratada é de 1% na população geral. O quadro surge de uma a quatro semanas após a instalação da angina.

A angina de Plaut Vincent é causada por uma associação de bactérias saprófitas da cavidade oral, que se tornam patogênicas em situação de má higiene oral e desnutrição, por exemplo.

A herpangina é causada pelo vírus Herpes Simplex (HSV) tipo I, por transmissão fecal-oral ou via respiratória. Suas lesões se apresentam como vesículas principalmente em pilares amigdalianos, úvula e palato mole.

O câncer de tonsila deve ser suspeitado diante de lesão ulcerada ou ulcero-necrótica unilateral, que não melhora com tratamento clínico. Etilismo e HPV são fatores de risco.