Genitálias podem ser fontes potencialmente importantes para a identificação de insetos, pois são variáveis e frequentemente auxiliam na discriminação de espécies muito similares. Apesar da relevância potencial da morfologia das genitálias, seu estudo morfológico é um procedimento raramente realizado, pois a dissecção da terminália causa danos irreparáveis aos espécimes.

A identificação de insetos por comparação com espécimes de uma coleção de referência é um método eficiente de identificação, mas depende da disponibilidade de uma coleção bem-organizada e identificada por especialistas. A grande vantagem deste sistema é que dispensa um conhecimento prévio sobre o táxon em questão para realização de uma identificação segura.

As chaves são ferramentas úteis no processo de identificação taxonômica. Há chaves pictóricas, chaves eletrônicas interativas e chaves de identificação tradicionais, que seguem uma organização linear de passos que necessariamente terminam em uma escolha dicotômica.

A identificação pode ser feita por comparação com descrições taxonômicas, pois há, para cada espécie, ao menos uma descrição taxonômica disponível (apesar de algumas publicações antigas serem pouco úteis como ferramenta de identificação devido ao texto muito superficial e à ausência de ilustrações adequadas).

Entre os métodos de identificação já propostos, os métodos genéticos aplicados por comparação de sequências de DNA de uma região específica, como o CO1. Apesar de amplamente utilizada, a identificação com dados moleculares é limitada à comparação de indivíduos adultos, pois os processos moleculares ocorridos durante o desenvolvimento impedem o uso de DNA de imaturos.