Métodos baseados em PCR (convencional ou em tempo real) para detecção de H. capsulatum têm como alvo diferentes regiões genômicas: regiões multicópias de DNA ribossômico.

O uso de testes de fixação de complemento e imunodifusão para diagnóstico de coccidioidomicose está bem estabelecido com amostras brutas de antígeno, conhecidas como coccidioidinas, que incluem o antígeno reativo de fixação de complemento, bem como diversas moléculas importantes.

Paracoccidioides spp. são considerados microrganismos exigentes, pois a recuperação desses patógenos da cultura é fácil e rápida, os testes comerciais de anticorpos ainda estão disponíveis e os métodos sorológicos não têm limitações.

O método “PCR (convencional ou em tempo real)” é composto por três extratos de antígenos (histoplasmina, coccidioidina e Coccidioides “TP”) para detecção de anticorpos. Lâminas de PCR (convencional ou em tempo real) são sondadas com amostras de soro de coccidioidomicose e histoplasmose de pacientes ou de indivíduos saudáveis e a detecção de imunocomplexos é realizada por imunofluorescência indireta.