Programa Nacional de Imunizações (PNI); Programa de Qualificação das Ações de Vigilância em Saúde; Programa de Treinamento em Epidemiologia Aplicada aos Serviços do SUS (EpiSUS).

Programa Nacional de Vigilância da Qualidade da Água para Consumo Humano (VIGIÁGUA); Saúde Ambiental e Qualidade do Ar (VIGIAR); Saúde de Populações Expostas a Contaminantes e Substâncias Químicas (VIGIPEQ).

Programa Nacional de Controle da Raiva dos Herbívoros (PNCRH); Programa Nacional de Sanidade Avícola (PNSA); Programa Nacional de Sanidade Apícola (PNSAb).

Programa Nacional de Sanidade dos Equídeos (PNSE); Programa Nacional de Vigilância para a Febre Aftosa (PNEFA); Programa Nacional de Controle e Erradicação da Brucelose e da Tuberculose Animal (PNCEBT).

Programa de Prevenção de Acidente de Trabalho; Programa de Prevenção de Intoxicação Exógena; Programa de Prevenção de Pneumoconioses.