As arqueias exibem organização celular altamente convergente com eucariontes, compartilhando identidades estruturais, como o sistema endomembranoso e o citoesqueleto complexo.

O domínio Archaea é, segundo a taxonomia, restrito a organismos fotossintéticos, cuja fisiologia depende exclusivamente da captura de energia luminosa por pigmentos específicos.

As arqueias possuem membranas compostas por lipídios de éter, além de sistemas enzimáticos e proteínas altamente estabilizadas, frequentemente associados a adaptações fisiológicas para ambientes extremos.

As arqueias apresentam núcleo verdadeiro delimitado por envelope nuclear duplo, o que constitui condição transicional entre procariontes e eucariontes.

as arqueias são desprovidas de metabolismo próprio, dependendo integralmente do hospedeiro ou do ambiente para a obtenção de energia e metabólitos intermediários.