A ecocardiografia funcional é utilizada principalmente para detectar anomalias anatômicas do coração, como cardiopatia congênita.

A avaliação ecocardiográfica inicial deve ser realizada por qualquer membro da equipe médica.

A ecocardiografia funcional pode ser útil para estimar a pré e a pós-carga, avaliar o tamanho e a direção do shunt do canal arterial e monitorar o efeito das drogas vasoativas no débito cardíaco.

O uso da ecocardiografia funcional não tem relevância na detecção de hipertensão pulmonar em recém-nascidos hipoxêmicos.

A ecocardiografia não é recomendada no contexto de choque transicional, pois o tratamento não melhora o prognóstico a longo prazo.