A taxonomia de micobactérias de crescimento rápido tem sido objeto de grande discussão, face às novas evidências geradas pelo sequenciamento completo dos genomas. Por outro lado, a segurança do paciente impõe uma limitação nas alterações taxonômicas. A nomenclatura vigente no “List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature” para o Complexo M. abscessus é: