Na fase aguda, o diagnóstico é realizado exclusivamente por marcadores sorológicos, enquanto na fase crônica, utiliza-se principalmente a pesquisa do parasita no sangue.

A fase aguda é confirmada por métodos parasitológicos, como o exame direto em esfregaço sanguíneo ou a gota espessa, enquanto na fase crônica predominam os métodos sorológicos, como o ELISA e a imunofluorescência indireta.

O diagnóstico das fases aguda e crônica é feito de maneira semelhante, utilizando-se, principalmente, exames sorológicos, como a reação de hemaglutinação indireta (RHI).

Na fase crônica, o diagnóstico é confirmado pela observação direta do parasita no sangue periférico, enquanto na fase aguda utilizam-se apenas testes moleculares, como a PCR.

A diferenciação entre as fases aguda e crônica baseia-se apenas na presença de sintomas, sem diferenças significativas nos métodos diagnósticos laboratoriais.