O design computacional de proteínas baseado em estrutura, em geral, e particularmente o design de anticorpos depende fortemente de dados estruturais tridimensionais de qualidade tanto para o modelo de design (nesse caso, o anticorpo) como para o alvo desejado (nesse caso, o antígeno) e para seu complexo. A modelagem de anticorpos avançou a ponto de a maioria do domínio variável do anticorpo poder ser modelada de forma confiável, e o sucesso na modelagem deve-se, em parte, às conformações estruturalmente canônicas da maioria das CDRs. Nesse contexto, contudo, segundo Fischman e Ofran (2018), continua sendo um desafio a obtenção de modelos precisos da variável