Níveis elevados de oxalato urinário podem causar formação de cálculos de oxalato de cálcio.

Cálculos de ácido úrico mais comumente se desenvolvem com resultado da diminuição da acidez da urina, que cristaliza o ácido úrico não dissociado.

Os fatores de risco gerais incluem doenças que aumentam a concentração urinária de sais, tanto pela maior excreção de cálcio ou de sais de ácido úrico quanto pela diminuição da excreção de citrato urinário.

Cálculos de cistina ocorrem apenas na presença de cistinúria.