O município tem papel central na notificação, investigação e encerramento dos casos, integrando os resultados laboratoriais do GAL ao SINAN, assegurando a consistência das informações para análise estadual e federal.

O município é responsável pelo registro inicial dos casos e pelo encaminhamento dos formulários, cabendo ao estado realizar a análise final e consolidar as informações no SINAN antes do envio ao nível federal.

O fluxo de dados ocorre de forma linear entre os níveis de gestão, partindo do município para o estado e, posteriormente, ao Ministério da Saúde, com etapas de revisão que evitam a retroalimentação do processo.

A análise epidemiológica é conduzida de forma centralizada pelo Ministério da Saúde, que consolida os bancos de dados enviados pelos estados e comunica eventuais inconsistências identificadas nas notificações.

O GAL e o SINAN funcionam de forma independente, sendo o primeiro voltado às rotinas laboratoriais e o segundo restrito à notificação clínica e à retroalimentação de processos, sem correlação entre os sistemas.