Nos trechos de cabeceira, predomina a produção primária autóctone, com abundância de algas filamentosas e baixa entrada de matéria orgânica alóctone.

Em rios de ordens entre 4 e 6, a relação produção primária/respiração tende a ser maior que 1, devido à maior penetração de luz e abundância de algas perifíticas e fitoplâncton.

Nos trechos de ordem acima de 7, a produção primária autóctone é dominante, pois a largura do canal permite alta penetração de luz e elevada taxa fotossintética em toda a coluna d’água.

O RCC afirma que a composição de organismos aquáticos é homogênea ao longo de todo o rio, já que o gradiente longitudinal não afeta a disponibilidade de energia e nutrientes.

O RCC tem como foco apenas a velocidade da correnteza nos trechos dos rios.