A betaoxidação representa uma série de reações que tem por objetivo a oxidação das longas cadeias carbônicas de ácidos graxos de dois em dois carbonos (moléculas de Acetil -CoA), que subsequentemente são substratos para o ciclo de Krebs.

A cadeia transportadora de elétrons, que ocorre na membrana mitocondrial externa, transporta elétrons do NADH e FADH2 através de proteínas carreadoras, localizadas na matriz mitocondrial, processo no qual ocorre a geração do gradiente de prótons entre o meio interno e externo, para a síntese de Trifosfato de Adenosina (ATP).

O gradiente de prótons produzido pela cadeia transportadora de elétrons é responsável pela geração da força próton-motriz, que movimenta a enzima ATP sintetase, realizando a hidrólise de ATP mitocondrial.

O ciclo de Krebs é uma importante via do metabolismo aeróbico e respiração celular, pois tem a capacidade de continuar a oxidação do acetil -CoA dentro da mitocôndria e, dessa forma, é a via metabólica que, quantitativamente, sintetiza mais moléculas de ATP.

A glicólise é uma via metabólica que ocorre na matriz mitocondrial, ativada especialmente em situações nas quais o organismo se encontra em um estado alimentado, ou seja, quando há predominância do catabolismo sobre o anabolismo.