O controle da leptospirose depende principalmente da aplicação emergencial de antibióticos profiláticos em massa nas áreas alagadas, sendo as ações educativas e de saneamento consideradas complementares e de responsabilidade exclusiva da vigilância epidemiológica.

A atuação do agente deve envolver orientação comunitária sobre medidas preventivas pós-enchente (como evitar contato com águas contaminadas e usar botas ou luvas), encaminhamento de casos suspeitos à unidade de saúde, identificação de criadouros e focos de roedores, e articulação com órgãos responsáveis pelo saneamento e limpeza urbana, reconhecendo que a leptospirose está diretamente relacionada à vulnerabilidade ambiental e social.

A intervenção do agente deve concentrar-se na aplicação imediata de raticidas e eliminação física de roedores, uma vez que a leptospirose é transmitida diretamente pelo contato com os animais, e não por água ou solo contaminado.

Em situações de enchente, a prevenção da leptospirose baseia-se na cloração intensiva da água potável e na vacinação humana anual, ações sob responsabilidade exclusiva do setor de vigilância sanitária.

As ações educativas pós-enchente devem priorizar apenas o descarte adequado do lixo, já que a infecção pela Leptospira ocorre principalmente por ingestão de alimentos contaminados e não por contato cutâneo com a água.