Na geração de imagens por PET, os dois fótons gerados pela aniquilação elétron-pósitron são detectados por um anel de detectores que se encontra ao redor do paciente; a partir desses dados, com o auxílio de um sistema computacional, são geradas as imagens de cortes anatômicos pelo aparelho de PET.

Diferente dos aparelhos de SPECT (Single Photon Emission Computed Tomography), os aparelhos de PET não são capazes de gerar imagens tridimensionais.

As imagens geradas em PET ou SPECT são muito semelhantes, mas não se substituem, uma vez que utilizam radionuclídeos diferentes associados a moléculas marcadas diferentes.

Dos radionuclídeos utilizados em PET e produzidos pela aceleração de prótons, a reação utilizada para a geração do flúor18 é a que apresenta menor energia de feixe para ocorrer.