A mutação do gene APC, localizada no cromossomo 5q21, segue padrão de herança autossômico recessivo.

A mutação do gene MSH2 é a mais comum na PAF clássica, associada à presença de pólipos hamartomatosos.

A mutação germinativa do gene APC segue padrão dominante.

A presença de múltiplos pólipos hamartomatosos é suficiente para diagnóstico de PAF, independentemente de teste genético.

É causada por mutações somáticas do gene TP53 e está associada ao câncer de cólon em idosos.