Uma vez que a população tem acesso à fluoretação da água de abastecimento público, não é indicada a aplicação tópica de flúor, pois há risco de fluorose.

O flúor só atua por via sistêmica, de modo que é ineficaz quando aplicado topicamente sobre os dentes após a erupção.

A aplicação profissional de flúor é indicada apenas para crianças menores de 5 anos de idade, não sendo recomendada para adultos.

O flúor aplicado topicamente forma uma barreira física sobre o esmalte, o que impede qualquer contato com ácidos produzidos pelas bactérias.

Compostos como fluoreto de sódio, fluoreto de estanho e fluoreto de amina são formas químicas utilizadas na aplicação tópica do flúor, com diferentes concentrações e indicações clínicas.