A elevação e a anteriorização do complexo hiolaringeo são desencadeadas exclusivamente pela contração do músculo estilofaringeo, sendo este o principal responsável pela abertura do esfíncter esofágico superior (EES).

O fechamento do vestíbulo laríngeo ocorre em sentido descendente (cranial-caudal), iniciando-se pela adução das pregas vocais, seguida pelas pregas vestibulares e, por fim, pelo abaixamento da epiglote.

Durante a fase faríngea, a apneia de deglutição é um mecanismo reflexo coordenado pelo centro bulbar, ocorrendo predominantemente durante a fase expiratória do ciclo respiratório na maioria dos adultos saudáveis.

O reflexo de deglutição é mediado exclusivamente por fibras aferentes do nervo facial (VII), que enviam informações sensoriais ao trato solitário para iniciar a resposta motora involuntária.