A cárie dentária resulta de atividades metabólicas de bactérias nas comunidades microbianas dentárias, conhecidas como biofilmes (geralmente referidos como placa dentária). A presença de comunidades microbianas na superfície dentária é um pré-requisito para o desenvolvimento de lesões cariosas. A microbiota residente contribui direta ou indiretamente ao desenvolvimento normal do hospedeiro, e funciona como parte das defesas inatas do hospedeiro agindo como barreira à colonização permanente por organismos transitórios, alguns dos quais são potencialmente patogênicos. Os mecanismos envolvidos na resistência à colonização, feita pelos microrganismos residentes, NÃO incluem: