Apesar de ser rico em plantas endêmicas, o cerrado, por estar em uma posição central, compartilha espécies com outros biomas terrestres brasileiros.

Os principais ecossistemas brasileiros têm alta biodiversidade, porém a Mata Atlântica, maior reserva de água doce tropical, é a única que combina grande riqueza de espécies e altos níveis de endemismo.

Além da ocorrência de áreas sem sinais de exploração, o sistema de monitoramento da exploração madeireira (SIMEX) possibilita a identificação de área autorizada em área já explorada, crédito comercializado maior que o autorizado, área explorada acima do limite autorizado e área desmatada antes da autorização, entre outras.

Para estabilizar o setor madeireiro na Amazônia e promover o manejo florestal, devem-se adotar medidas para tornar mais eficiente o sistema de controle e o monitoramento florestal e implementar as concessões florestais.

A capacidade de produção da floresta, os aspectos sociais e trabalhistas, o respeito ao meio ambiente e a viabilidade econômica constituem princípios básicos do manejo florestal sustentável em florestas tropicais.

No sistema de monitoramento da exploração madeireira (SIMEX) o índice normalizado de diferença de fração (NDFI) próximo de um indica exploração de baixa qualidade.

Do ponto de vista conservacionista, os sistemas agroflorestais, além de promoverem a proteção do solo, induzem à menor pressão na utilização de florestas nativas como meio de extração de madeira, principalmente para a produção de energia.

O plantio de palmeira real sob o plantio de eucalipto é exemplo de sistema agroflorestal com culturas coincidentes, visto que são culturas de épocas diferentes de plantio, mas de mesma época de colheita.

No sistema agroflorestal denominado Taungya, são associadas culturas anuais de ciclo longo com espécie florestal por tempo limitado, em geral, até o primeiro corte das árvores.

A adubação verde é um recurso utilizado nos sistemas agroflorestais com vários benefícios para a cultura a ser implantada, como a descompactação do solo, que melhora a porosidade e a atividade microbiana.