Os camundongos specific patogen free devem ser monitorados quanto a sua microbiota residente para se ter certeza de que patógenos indesejáveis não tenham se estabelecido nas colônias. As amostras microbiológicas devem ser colhidas ao acaso nos animais, nos materiais e nos equipamentos e no ambiente.

Os camundongos specific patogen free albergam somente micro-organismos não patogênicos, apresentando uma microbiota conhecida incapaz de lhes produzir doenças.

As veias laterais da cauda de camundongos e ratos servem como locais de coleta de sangue após dilatação por calor e garrote.

Ratos maiores devem ser contidos firmemente, mas de forma gentil, colocando-se a mão fortemente apoiada sobre seu dorso e sua caixa torácica. A cabeça pode ser segurada com o polegar e o indicador, imediatamente atrás da mandíbula.

Quanto ao manejo de colônias, denomina-se colônia de fundação aquela cuja finalidade é autoperpetuar-se, possibilitando sua manutenção. Nela, todos os acasalamentos são monogâmicos permanentes, com animais identificados individualmente e registrados para conferir um perfil único.

O período de gestação das ratas se estende de 19 a 22 dias. A ninhada de ratas Wistar pode ter até 16 filhotes por parto.

O desmame de cobaias deve ser realizado, dependendo do tipo de criação, com 4 semanas de idade ou quando alcançam 150 gramas.

A contenção física de camundongos é realizada levantando-se o animal pela base da cauda e, imediatamente, dando-se suporte ao seu peso, em uma superfície ou na mão do manipulador.

Os hamsters consomem, aproximadamente, de 5 a 12 g de alimento e bebem 10 mL de água, para cada 100 g de peso corpóreo, diariamente. Em fases de crescimento e reprodução, dietas com baixo teor proteico não são adequadas. Deficiências proteicas na dieta dos hamsters podem causar alopecia e teores elevados de lipídeos, entre 7% e 9%, podem implicar no aumento de mortalidade.

A ingestão alimentar, no caso das cobaias varia com a temperatura ambiente, com a fase de vida reprodutiva e com a umidade relativa. Da mesma forma que os primatas, as cobaias não possuem a enzima L-glucolactona oxidase, integrante da via metabólica que leva à formação de vitamina C a partir da glicose.